《生命起源的七条线索》一书的作者英国物理化学家凯恩斯·史密斯（1995）说，“一个进化过程曾于从前某个时间开始，但现在却似乎已不再有任何进化过程的新的开始。生命之树目前已枝繁叶茂，但这样的树却显然只有一棵，在同一个场地甚至没有任何近代幼苗存在的迹象。那么，为什么现代或近代自然发生的迹象均不存在呢？……假定大自然的规律40亿年前与现在并无任何区别，那么这样的有机物，即那种我们称之为原生有机物的东西，为什么现在却找不到了呢？为什么我们对此一无所知呢？这是不是因为地球上总的已经改变的缘故？是不是因为产生并维持最初的生命火花所需的条件已不再存在？这是一个标准答案”。

　　卟啉环不限于叶绿素和细胞色素，还存在于一些古菌的辅酶中。甲烷古菌有一些独特的辅酶，这些酶存在于一些超嗜热古菌以及有限的真细菌之中。这些独特的辅酶也被认为是支持古菌进化的基础之一，而在真细菌中的古菌辅酶则被认为是近期基因侧向转移的（KimandGadd2008）。在真细菌和真核生物中的一碳单位的载体（C1-carrier）为四氢叶酸（H4F）和S-腺苷甲硫氨酸（SAM)，而在甲烷古菌中取而代之的是辅酶甲烷呋喃（MF）、四氢甲烷喋呤（H4MPT）和辅酶M；除了这些一碳单位的载体外，产甲烷古菌还利用辅酶F420、辅酶F430和7-巯基庚酰基苏氨酸磷酸（图24）。