凯恩斯·史密斯(1995)说,“我们又如何能够描述进化最初阶段的情形呢?我们当然无法确切描述当时的情况;因为各种细节都已失去。但原则还是可以理解的,我们应该能理解激励进化的种种情况以及进化可采取的方向”。我很赞赏他的这种原则性的说法,虽然我完全不能赞同他在《生命起源的七条线索》一书中提出的关于生命起源的假想径!
在极少数的古菌中未发现细胞色素基因。有学者(王子晖2011b)就认为,缺乏细胞色素是古老的象征,因此作为LUCA的应该缺乏细胞色素。在古菌中,发现细胞色素基因在甲烷火菌(Methanopyruskandleri,简称Mka)、热自养甲烷嗜热杆菌(Methanothermobacterthermautotrophicum,简称Mth)、甲烷球菌(Methanococcusiannaschii,简称Mia)、激烈火球菌(Pyrococcusfuriosus,简称Pfu)、深海热球菌(Pyrococcusabyssi,简称Pab)和超嗜热古菌(简称Pyrococcushorikoshii,简称Pho)的基因组中缺失,Mka、Mth和Mia利用H2和CO2合成甲烷,而Pfu、Pab和Pho则代谢产生H2和CO2,这些缺乏细胞色素的被划归为进化中异常保守的远古六菌,因此推测它们与缺乏细胞色素的LUCA关系很近。