现在一般认为，团聚体学说和微学说都只具有历史意义，因为现今对原始细胞起源的研究多转向囊泡，即所谓的囊泡学说（Vesicletheory）。这主要是基于这样一个能自然发生的现象：当特定的两亲分散到水中时，会自发形成脂质体及其他类型的囊泡（图2）。脂通过这样一种装配特性，可形成双层半透膜，封闭出一个内部水，在和囊泡内提供了一个疏水屏障。囊泡的形成造成了三相微观混合系统（内部/边界/外部），从而能够建立化学梯度、大分泌、选择渗透性和最重要的细胞类性的产生（StanoandLuisi2011）。

　　与团聚体学说和微学说有所不同的是，囊泡学说重点关注了膜的自动形成问题，这固然重要，但它还是解释不了囊泡中的生物大（如蛋白质和核酸等）以及复杂的代谢系统是如何以及为什么形成的问题。