抛开现今极为复杂的遗传信息承载和蛋白质合成的功能，仅从最原始的可能性考虑，在光合作用起源的最初阶段，核苷酸（或衍生物）可能承担了三个重要功能：1）能量的货币（ATP），2）电子和质子载体（DADP+/NADPH），以及3）可能的氨基酸的载体（后来发展到多肽链的合成）。或者说，原始光合作用的功能行使并不需要核酸，但光化学反应的化学能的载体却是核苷酸（ATP）及其衍生物（NADPH）。此外，在利用光合碳合成的糖类进一步通过呼吸作用（糖酵解和三羧酸循环，图16-17）产生的另外两种强还原性物质—NADH和FADH也是核苷酸的衍生物。形象地说，ATP和NADPH恰似驱动生命车轮滚滚前行的发动机。

　　为何以及怎样是三联密码子呢？对20个蛋白质氨基酸来说，由于核酸只含有四种不同碱基，使用非重复的三联密码子已经足够了，因为这将有64个三联体密码子（43=64）分配给氨基酸和终止符号。如果一个密码子只使用两个碱基，将只能决定16种氨基酸（42=16），如果使用过多的碱基（如4个以上，44=256）则过于累赘。密码子应该是氨基酸—tRNA（密码子-反密码子）—核糖体（mRNA-蛋白质）在结构与反应上通过复杂而漫长的立体化学相互作用演化而来，自然选择的方向是建立一种信息化的准确而高效地合成多肽链的反应与调控体系。