应该可以这样说,像在高能的核苷酸衍生物(ATP)大量存在的前提条件下,核苷酸缩合而成不同链长的类RNA是完全可能的(即使没有酶的催化),这些中可能有一些特殊的结构容易从氨酰-AMP接受特定的氨基酸(处于活化的状态)就发展成了tRNA,而另一些类rRNA的组合可能偶然获得了组装活化的氨基酸(形成肽链)的能力(将其链接到另一个氨基酸或肽链上),在rRNA介导的肽键生成中应该不需要额外的能量了。如果这种组装结构得到选择与确立,进一步,一些类mRNA和类tRNA可能就会在与这种组装结构的随机组合中,使肽链生成更为程序化与高效化,进而使肽链合成机构得到不断的完善。在这种过程中,RNA也成功地分化出三种不同的类型—mRNA、tRNA与rRNA,这可能是蛋白质合成程序化和高效化之必需。
只有一个高效的光合作用系统才能生产更多的有机物,这种光合系统就会被更广泛地或扩展—这可能就是光合系统不断向高效方向演化的核心动力,这也是自然选择的方向性。因此,我猜测最初的酶可能就是在与光合作用过程相关的各种氧化还原反应与多肽/蛋白质的相互作用过程中逐渐形成的,如果通过酶促反应可以不断地提高反应速率,就可能获得竞争与被选择下来的优势,这应该就是酶促反应速率能够达到惊人速度的根本缘由。这样,蛋白质一方面成为光合系统的结构支撑部分,另一方面成为推动一系列生化反应高效进行的催化剂,因此就出现了酶蛋白与结构蛋白之间在功能上的分化。